醉酒不起訴并不會留下案底。因為醉酒不起訴也就免于刑事處罰了，僅僅只有行政處罰，也就不會留下有案底。

需要注意，醉駕雖然可以不起訴，但是也不是所有的醉駕都能夠免于起訴，只有經(jīng)過檢測血液中的酒精含量低于150mg/100ml的，并且不具有《關(guān)于危險駕駛（醉駕）犯罪案件不起訴參考標準》第五條規(guī)定情形的，可以適用相對免起訴。超過150mg/100ml則按醉駕從重處理情節(jié)判決。

醉駕不起訴了結(jié)案流程

一、宣布、寄送不起訴決定書：人民檢察院決定不起訴的，應當將不起訴決定書公開宣布，并將不起訴決定書送至以下單位。

（1）被不起訴人和他的所在單位，被起訴人正在關(guān)押的，應當立即釋放；

（2）如果是公安機關(guān)移送的案件，應送至公安機關(guān)；

（3）如果案件有被害人，應將不起訴決定書送至被害人。

二、接觸扣押、凍結(jié)：人民檢察作出不起訴的決定后，就意味著刑事訴訟的終止，公安機關(guān)應以口頭或書面的形式解除犯罪嫌疑人財物的凍結(jié)。

三、移送有關(guān)主管機關(guān)：雖然醉駕不起訴，不會受到刑事處罰，但行政處罰是少不了的；不起訴后，人民檢察院會將案件和不起訴決定書交給有關(guān)主管部門處理，給予犯罪人行政處罰、行政處分或沒收其違法所得。